La coordination inter-réseaux Natura 2000 regroupe la Fédération des Parcs, la Fédération des Conservatoires des espaces naturels, Réserves naturelles de France et le réseau des Grands sites de France. Créé en 2019, son rôle est d'apporter une dimension politique à l'animation du réseau d'acteurs impliqués dans Natura 2000. La création du club des élus en est l'un des outils.