Dynamique de population, écologie alimentaire, phylogéographie et conservation du puffin d'Audubon (Puffinus...

Depuis 1995, la création de la réserve naturelle des îlets de Sainte-Anne a permis de protéger des nuisances humaines de nombreuses espèces d'oiseaux marins, dont le puffin d'Audubon, venant y établir leur nid. Cette espèce, protégée en Martinique depuis 1989, est considérée comme menacée dans la Caraïbe (Schreiber et Lee, 2000) car sa population de petite taille est en diminution. Les suivis scientifiques opérés par le Parc naturel régional de la Martinique, gestionnaire du site, ainsi que la base de données de baguage du puffin d'Audubon âgée de 17 ans (1995- 2012, excepté 1999) faite par un réseau d'observateurs passionnées constitueront des éléments de base, fortement utiles, dans le cadre de cette thèse. Une première analyse de la base de données de baguage a été faite en 2009 lors de mon stage de M2 et reste en suspens la nécessité de compléter nos connaissances sur les principaux facteurs qui pourraient expliquer la diminution visible de l'effectif de puffins d'Audubon de la RNISA de 1997 à 2007 (diminution de couples nicheurs) . Dans un premier temps, une étude phylogéographique permettra de comprendre les phénomènes de spéciation ayant conduit à la distribution et à la structuration géographique actuelle des populations à l'échelle de la Caraïbe. Cette étude servira à progresser sur la taxonomie actuelle du genre Puffinus qui n'est pas encore très claire en comparant également deux sous espèces de l'Atlantique. L'étude de la variabilité de l'ADN mitochondrial permettra de mesurer l'ampleur de la diversité génétique intra et inter populations nous donnant une indication sur leur degré d'isolement. Une méthode complémentaire d'analyse de l'isolement des populations, la repasse de vocalisations entre les colonies indiquera leur capacité de reconnaissance et d'échanges. Ensuite, une analyse plus poussée de la base de données sera effectuée pour créer des profils démographiques de survie et de fécondité par classe d'âge et de taille de la population à partir de la méthode de CMR (capture-marquage-recapture). Les facteurs de régulation de la population seront ensuite analysés :soit « dépendante de la densité » c’est à dire limitée par des facteurs biologiques (prédation, parasitisme, compétition), soit « indépendante de la densité » contrôlée par des facteurs physiques (vent, courant, température…). Le deuxième cas est le plus fréquent, la croissance est alors limitée par la disponibilité des ressources. Pour tenter d'expliquer les variations démographiques, on s'intéressera à l'écologie alimentaire de l'oiseau. Les oiseaux marins dépendent entièrement des ressources marines pour s'alimenter, la stratégie alimentaire occupe alors une place centrale dans la vie de l'individu. On s'intéressera aux mécanismes d'acquisition et d'allocation des proies chez l'individu en fonction de la répartition des ressources marines. Seront mis en évidence les coûts de l’incubation et de l’élevage (perte de masse) et bénéfices (efficacité de la recherche alimentaire) lors de la recherche et l'acquisition de nourriture. Les oiseaux seront équipés de systèmes intégrés de télémétrie satellitaire : des loggers de type GLS qui permettent de localiser les zones d’alimentation, des loggers TDR pour identifier les profondeurs du plongeur et la température de l’eau. L'analyse des isotopes (récolte des plumes) permettra de connaître le niveau trophique de l'espèce et l'on identifiera également les restes de proies. De récentes études ont montré que les oiseaux marins pouvaient constituer des indicateurs potentiels des variations climatiques dans l'océan (Boyd et al. 2006, Piatt et al. 2007, Parsons et al. 2008). On étudiera le temps de réponse du puffin d'Audubon face aux variabilités environnementales et aux changements climatiques (fréquence el Nino, cyclones..). La réponse des facteurs de régulation (disponibilité des proies, prédation...) face aux variables climatiques (SST, anomalies de hauteurs d’eau…) sera analysée (utilisation de variables externes en CMR).